Soudce zpravodaj Jan Wintr při odůvodnění rozhodnutí uvedl, že byl porušen ústavní princip tzv. plné náhrady škody. Vylita nedobrovolně skončil jak v NATO, tak na ministerstvu obrany.
NBÚ prověrku Vylitovi odebral, když před lety požádal o prověrku na stupeň přísně tajné. Tehdy mu ji úřad nejenže neudělil, ale současně mu odebral i tu stávající na úrovni tajné.
Spor ministerstva obrany a Jana Vylity se vleče. Ačkoli soud před časem pravomocně konstatoval, že Vylita výpověď před dvěma roky nedostal a zůstává zaměstnancem úřadu, stále není rozhodnuto.
Bývalý generální sekretář ministerstva obrany Jan Vylita zůstává zaměstnancem resortu. Kvůli ztrátě bezpečnostní prověrky dostal před dvěma lety výpověď. Úřad mu ji ale podle soudu špatně doručil.